过去曾有人将孤独症与儿童精神分裂症混同。二者的症状有相似之处，如眼神不谋合，兴趣范围狭小等，但是二者在出现率性别差异不同（孤独症男、女孩儿比例为4：1，精神分裂症男女相当）。遗传关系不同（孤独症与遗传关系不大，精神分裂症有明显家族遗传倾向）。精神分裂症常有幻听、妄想症状，而孤独症很少出现。今后随着研究的深入将对二者认识更加进一步，并从医疗教育方面加以区别对待。
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